這問題我同時解決了自己的問題，但是問題遺跡。我忘記了 \flalign* env 中的 \text{} 包裝器並收到了上述錯誤。現在，數學部分沒有包含在 \text{} 中（廢話），這顯然引出了一個問題：LaTeX 如何知道什麼是數學，什麼是文字？它不能是導致錯誤的純文字或位置或列，因為以下內容是無害的：
\begin{flalign*}
\omega=omega && \phi=phi && comment
\end{flalign*}
我的 \ref{} 連結在 MWE 中都沒有任何麻煩。除了這些之外，任何東西都只是明文。知道是什麼造成了麻煩嗎？ （註：一切都在 amsmath 推論/證明環境。）