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共同對應 2 個檔案中的欄位並列印不同的值

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共同對應 2 個檔案中的欄位並列印不同的值

我有一個檔案（file-1），如下所示，

DIP-10097N|refseq:NP_416170|uniprotkb:P30015
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177
DIP-10168N|refseq:NP_418766|uniprotkb:P15005
DIP-10199N|refseq:NP_415632|uniprotkb:P30958
DIP-10358N|refseq:NP_418659|uniprotkb:P28903
DIP-10440N|refseq:NP_289596|uniprotkb:P20082
DIP-10441N|refseq:NP_417502|uniprotkb:P20083
DIP-10441N|refseq:NP_417502|uniprotkb:P20083
DIP-10467N|refseq:NP_415423|uniprotkb:P09373
DIP-10469N|refseq:NP_418386|uniprotkb:P32674
DIP-10562N|refseq:NP_418370|uniprotkb:P17888
DIP-10582N|refseq:NP_414864|uniprotkb:P77743
DIP-10592N|refseq:NP_415819|uniprotkb:P37344

另一個（file-2）看起來像這樣，

DIP-10331N|refseq:NP_311078|uniprotkb:P12638     DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177
DIP-10331N|refseq:NP_311078|uniprotkb:P12638    DIP-10840N|refseq:NP_414640|uniprotkb:P10408
DIP-1025N|refseq:NP_414574|uniprotkb:P00968     DIP-10097N|refseq:NP_416170|uniprotkb:P30015
DIP-10467N|refseq:NP_415423|uniprotkb:P09373    DIP-10097N|refseq:NP_416170|uniprotkb:P30015
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177    DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177    DIP-10750N|refseq:NP_289799|uniprotkb:P02410
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177    DIP-10757N|refseq:NP_288150|uniprotkb:P02421

在輸出中，我想要列印 file-1 的內容加上 file-2 任一列中的值，該值與另一列中 file-1 的值相同。像這樣，

DIP-10097N|refseq:NP_416170|uniprotkb:P30015 DIP-1025N|refseq:NP_414574|uniprotkb:P00968
DIP-10097N|refseq:NP_416170|uniprotkb:P30015 DIP-10467N|refseq:NP_415423|uniprotkb:P09373
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177 DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177 DIP-10750N|refseq:NP_289799|uniprotkb:P02410
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177    DIP-10757N|refseq:NP_288150|uniprotkb:P02421
DIP-10117N|refseq:NP_414973|uniprotkb:P08177 DIP-10331N|refseq:NP_311078|uniprotkb:P12638
DIP-10467N|refseq:NP_415423|uniprotkb:P09373 DIP-10097N|refseq:NP_416170|uniprotkb:P30015

有沒有辦法可以使用 awk 或 grep 來完成此操作。任何幫助將不勝感激。

答案1

這是眾所周知的操作awk— 從金鑰檔案收集數組，然後使用該數組來操作第二個檔案值

awk '
    FNR==NR{
            A[$2] = A[$2] " " $1
            next
    }
    $1 in A{
            for(i=1;i<=split(A[$1], B);i++)
                print $1 B[i]
    }
    ' file2 file1

或者更短一點：

awk '
    FNR==NR{
            A[$2] = A[$2] $2 " " $1 "\n"
            next
    }
    $1 in A{
            printf "%s", A[$1]
    }
    ' file2 file1

其他變體

grep -f <(cat -E file1) file2 |
sed 's/\(\S*\)\s*\(\S*\)/\2\t\1/' |
sort

最後最簡單的（對我來說）：

join -2 2 file1 <(sort -k2 file2)

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