テーブルをダンプする際のクエリ中に MySQL サーバーへの接続が失われました

Question

すべてのデータベースをダンプしようとしているのですが、エラーが発生します「テーブルをダンプする際のクエリ中に MySQL サーバーへの接続が失われました」ファイルは常に 781M に達します。

設定してみました最大許容パケット = 512M下に[mysqld]以下[mysqlダンプ]でphpMySQL の mysql.cnf ファイル、しかし、動作しませんでした。 1024M に設定してみました。何も起こりませんでした。

これは Apache が RAM をほぼすべて使用しているために発生していると思いますが、ファイルが 781M になるとダンプが常に停止するため、確信はありません。

/etc/mysql/my.cnf:

#
# The MySQL database server configuration file.
#
# You can copy this to one of:
# - "/etc/mysql/my.cnf" to set global options,
# - "~/.my.cnf" to set user-specific options.
#
# One can use all long options that the program supports.
# Run program with --help to get a list of available options and with
# --print-defaults to see which it would actually understand and use.
#
# For explanations see
# http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/server-system-variables.html

# This will be passed to all mysql clients
# It has been reported that passwords should be enclosed with ticks/quotes
# escpecially if they contain "#" chars...
# Remember to edit /etc/mysql/debian.cnf when changing the socket location.
[client]
port            = 3306
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock

# Here is entries for some specific programs
# The following values assume you have at least 32M ram

# This was formally known as [safe_mysqld]. Both versions are currently parsed.
[mysqld_safe]
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock
nice            = 0
log_error=/var/log/mysql/mysql_error.log

[mysqld]
#
# * Basic Settings
#
user            = mysql
pid-file        = /var/run/mysqld/mysqld.pid
socket          = /var/run/mysqld/mysqld.sock
port            = 3306
basedir         = /usr
datadir         = /var/lib/mysql
tmpdir          = /tmp
language        = /usr/share/mysql/english
skip-external-locking
log_error=/var/log/mysql/mysql_error.log
max_allowed_packet = 512M

# Replic    
server-id=2
master-host=hostip
master-user=slaveusr
master-password=slavepass
master-port=3306

#
# Instead of skip-networking the default is now to listen only on
# localhost which is more compatible and is not less secure.
bind-address            = 0.0.0.0
#
# * Fine Tuning
#
key_buffer              = 16M
thread_stack            = 192K
thread_cache_size       = 8
# This replaces the startup script and checks MyISAM tables if needed
# the first time they are touched
myisam-recover         = BACKUP
#max_connections        = 100
#table_cache            = 64
#thread_concurrency     = 10
#
# * Query Cache Configuration
#
query_cache_limit       = 1M
query_cache_size        = 16M
#
# * Logging and Replication
#
# Both location gets rotated by the cronjob.
# Be aware that this log type is a performance killer.
# As of 5.1 you can enable the log at runtime!
#general_log_file        = /var/log/mysql/mysql.log
#general_log             = 1
#
# Error logging goes to syslog due to 
/etc/mysql/conf.d/mysqld_safe_syslog.cnf.
#
# Here you can see queries with especially long duration
#log_slow_queries       = /var/log/mysql/mysql-slow.log
#long_query_time = 2
#log-queries-not-using-indexes
#
# The following can be used as easy to replay backup logs or for replication.
# note: if you are setting up a replication slave, see README.Debian about
#       other settings you may need to change.
#server-id              = 1
#log_bin                        = /var/log/mysql/mysql-bin.log
expire_logs_days        = 10
max_binlog_size         = 100M
#binlog_do_db           = include_database_name
#binlog_ignore_db       = include_database_name
#
# * InnoDB
#
# InnoDB is enabled by default with a 10MB datafile in /var/lib/mysql/.
# Read the manual for more InnoDB related options. There are many!
#
# * Security Features
#
# Read the manual, too, if you want chroot!
# chroot = /var/lib/mysql/
#
# For generating SSL certificates I recommend the OpenSSL GUI "tinyca".
#
# ssl-ca=/etc/mysql/cacert.pem
# ssl-cert=/etc/mysql/server-cert.pem
# ssl-key=/etc/mysql/server-key.pem

[mysqldump]
quick
quote-names
max_allowed_packet = 512M


[mysql]
#no-auto-rehash # faster start of mysql but no tab completition

[isamchk]
key_buffer              = 16M

#
# * IMPORTANT: Additional settings that can override those from this file!
#   The files must end with '.cnf', otherwise they'll be ignored.
#
!includedir /etc/mysql/conf.d/

私は試したmysqlcheck -A --自動修復私もそうでしたが、しばらくするとDCになりました（走っているときよりもmysqlダンプ）。

何か案は？

編集：

特定のテーブル「bandeira」をダンプしようとすると接続が失われます。

         2073 Query     SET SESSION character_set_results = 'binary'
         2073 Query     use `ct1222`
         2073 Query     select @@collation_database
         2073 Query     SHOW TRIGGERS LIKE 'baixa\_prod'
         2073 Query     SET SESSION character_set_results = 'utf8'
         2073 Query     show table status like 'bandeira'
         2073 Query     SET OPTION SQL_QUOTE_SHOW_CREATE=1
         2073 Query     SET SESSION character_set_results = 'binary'
         2073 Query     show create table `bandeira`
         2073 Query     SET SESSION character_set_results = 'utf8'
         2073 Query     show fields from `bandeira`
         2073 Query     SELECT /*!40001 SQL_NO_CACHE */ * FROM `bandeira`

私は走ったmysqlチェックそしてそれは大丈夫だと言っています:

# mysqlcheck ct1222 bandeira
ct1222.bandeira                                    OK

mysql_error.log:

InnoDB: Error: tried to read 16384 bytes at offset 0 7290880.
InnoDB: Was only able to read -1.
180829 17:49:36  InnoDB: Operating system error number 5 in a file operation.
InnoDB: Error number 5 means 'Input/output error'.
InnoDB: Some operating system error numbers are described at
InnoDB: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/operating-system-error-codes.html
InnoDB: File operation call: 'read'.
InnoDB: Cannot continue operation.
180829 17:49:38 mysqld_safe Number of processes running now: 0
180829 17:49:38 mysqld_safe mysqld restarted
180829 17:49:38 [Warning] 'for replication startup options' is deprecated and will be removed in a future release. Please use ''CHANGE MASTER'' instead.
180829 17:49:38 [Note] Plugin 'FEDERATED' is disabled.
180829 17:49:38  InnoDB: Initializing buffer pool, size = 8.0M
180829 17:49:38  InnoDB: Completed initialization of buffer pool
InnoDB: The log sequence number in ibdata files does not match
InnoDB: the log sequence number in the ib_logfiles!
180829 17:49:38  InnoDB: Database was not shut down normally!
InnoDB: Starting crash recovery.
InnoDB: Reading tablespace information from the .ibd files...
InnoDB: Restoring possible half-written data pages from the doublewrite
InnoDB: buffer...
180829 17:49:41  InnoDB: Started; log sequence number

Answer 1

ハードウェアに問題があるようです。

具体的には、ハード ドライブに障害があるようです。InnoDB がディスクからページを読み取ろうとしたときに、回復不可能な I/O エラーが発生したため、読み取ることができませんでした。これは致命的な問題であるため、サーバーは実際に停止してクラッシュし、接続が失われます。

その後はmysqld_safe Number of processes running now: 0MySQLが再起動してエラーから回復するだけです。実際の誤差はその線より上にあります（言い換えれば、以下の内容に驚いたり気を散らされたりしないでください。）

バックアップを作成すると同じエラーが発生するため、バックアップがないと推測します。

しかし、これは厳密には「MySQL の問題」ではないようです。影響を受けるファイルをコピーすると、同じエラーが発生するため、MySQL のファイルを別のディスクにコピーすることもできないことがわかります。どのファイルがコピーされるかは、 の設定によって異なりますinnodb_file_per_table。 に設定されている場合、0回復はそれだけ複雑になります。