Der größte Teil des Baumes verschwindet, wenn er zu groß ist

Der größte Teil des Baumes verschwindet, wenn er zu groß ist

Ich versuche, Suffixbäume für einen Bericht in Latex zu zeichnen. Da ich Bäume programmiere, drucke ich sie einfach im Qtree-Format aus meinem Code aus, sodass ich sie nicht manuell erstellen muss.

Bei kleinen Bäumen funktioniert das hervorragend. (Das übliche „Bananen“-Beispiel folgt)

\documentclass{article}
\usepackage{graphics}
\usepackage{qtree}

\begin{document}
    \begin{center}
        \Tree[.  [.\$ ]
        [.banana\$ ]
        [.a [.n [.a [.na\$ ]
        [.\$ ]
        ]  ] [.\$ ]
        ] [.n [.a [.na\$ ]
        [.\$ ]
        ]  ]  ]
    \end{center}
\end{document}

Suffixbaum für $banana$

Wenn ich aber einen größeren Baum zeichnen möchte, etwa „ichweißnichtsgroßes“, verwende ich dasselbe Verfahren:

\documentclass{article}
\usepackage{graphics}
\usepackage{qtree}

\begin{document}
    \begin{center}
        \Tree[.  [.\$idontknowsomethingbig\$ ]
        [.i [.dontknowsomethingbig\$ ]
        [.ngbig\$ ]
        [.g\$ ]
        ] [.dontknowsomethingbig\$ ]
        [.o [.ntknowsomethingbig\$ ]
        [.wsomethingbig\$ ]
        [.methingbig\$ ]
        ] [.n [.tknowsomethingbig\$ ]
        [.owsomethingbig\$ ]
        [.gbig\$ ]
        ] [.t [.knowsomethingbig\$ ]
        [.hingbig\$ ]
        ] [.knowsomethingbig\$ ]
        [.wsomethingbig\$ ]
        [.somethingbig\$ ]
        [.methingbig\$ ]
        [.ethingbig\$ ]
        [.hingbig\$ ]
        [.g [.big\$ ]
        [.\$ ]
        ] [.big\$ ]
        ]
    \end{center}
\end{document}

Ich bekomme nur Folgendes

gebrochener Baum

Abhängig von der Eingabe erhalte ich möglicherweise den letzten Zweig oder nur ein Wort wie in diesem Fall.

Ich vermute, dass der Code syntaktisch korrekt ist und dass das Problem darin liegt, dass er zu groß ist und Latex dadurch verwirrt wird. Aber meines Wissens nach könnte es alles Mögliche sein.

Antwort1

Das Problem ist, wie in den Kommentaren erläutert, dassqtreekann nicht mehr als 14 Äste verarbeiten. Die Lösung war, stattdessen einfach forest zu verwenden. Damit kann ich jetzt größere Bäume zeichnen, wie diesen:

Großer zufälliger Genombaum

Was kommt von:

\documentclass[border=1mm]{standalone}
\usepackage{graphics}
\usepackage{forest}


\begin{document}

        \begin{forest}
            for tree={
                calign=center,
                grow'=east,
                parent anchor=east, child anchor=west,
                text height=1.4ex, text depth=0.2ex 
            }
            [.  [.\$GATTACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.G [.A [.T [.TACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.G [.C [.TAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ] [.AGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.CTGS\$ ]
            ]  ] [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.A [.G [.C [.T [.A [.TATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ]  ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GATCTGS\$ ]
            ]  ] [.CGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.G [.CTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.ATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ] [.T [.C [.G [.ATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.TAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ] [.AGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.S\$ ]
            ] [.A [.T [.TACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.A [.G [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.AGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ]  ] [.TCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.G [.C [.TAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.ATCTGS\$ ]
            ] [.C [.GTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.TGS\$ ]
            ]  ] [.CATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.G [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.A [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GATCTGS\$ ]
            ] [.G [.CTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ]  ]  ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ] [.T [.TACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.A [.CATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.G [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.A [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GATCTGS\$ ]
            ] [.G [.CTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ]  ]  ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.CGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GATCTGS\$ ]
            ]  ] [.G [.A [.T [.GCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.CTGS\$ ]
            ]  ] [.C [.TAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.S\$ ]
            ] [.C [.G [.T [.CGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.AGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.ATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.CGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.TGS\$ ]
            ]  ] [.C [.ATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.T [.G [.ATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.S\$ ]
            ] [.A [.G [.C [.T [.A [.TATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ]  ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GATCTGS\$ ]
            ]  ] [.CGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.G [.T [.CGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.AGCTATGATCTGS\$ ]
            ] [.A [.T [.GCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.AGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ] [.C [.TCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            [.GATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
            ]  ]  ] [.S\$ ]
            ] 
        \end{forest}  


\end{document}

Die Syntax in forestunterscheidet sich von qtree, daher hat jeder Knoten in diesem Beispiel ein zusätzliches '.'-Zeichen. Denken Sie daran, wenn Sie diese Antwort als Beispiel für den Aufbau von Bäumen mithilfe von forest verwenden :)

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