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Kopieren Sie einen Teil des Inhalts der vorherigen Zeile in die folgende

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Kopieren Sie einen Teil des Inhalts der vorherigen Zeile in die folgende

Ich habe eine Datei mit folgender Struktur:

GO:0000001      mitochondrion inheritance
GO:0000002      mitochondrial genome maintenance
GO:0000003      reproduction
alt_id: GO:0019952
alt_id: GO:0050876
GO:0000005      obsolete ribosomal chaperone activity
GO:0000006      high-affinity zinc uptake transmembrane transporter activity
GO:0000007      low-affinity zinc ion transmembrane transporter activity
GO:0000008      obsolete thioredoxin
alt_id: GO:0000013
GO:0000009      alpha-1,6-mannosyltransferase activity

Wo es steht, alt_idist es eine Alternative zum vorherigen Code. Ich möchte jedem die Definition des vorherigen GO:hinzufügen , das heißt, ich möchte eine Ausgabe wie diese:alt_idGO:

GO:0000001      mitochondrion inheritance
GO:0000002      mitochondrial genome maintenance
GO:0000003      reproduction
alt_id: GO:0019952     reproduction
alt_id: GO:0050876     reproduction
GO:0000005      obsolete ribosomal chaperone activity
GO:0000006      high-affinity zinc uptake transmembrane transporter activity
GO:0000007      low-affinity zinc ion transmembrane transporter activity
GO:0000008      obsolete thioredoxin
alt_id: GO:0000013      obsolete thioredoxin
GO:0000009      alpha-1,6-mannosyltransferase activity

Wie kann ich den Inhalt der vorherigen Zeile in die folgende kopieren? Ich arbeite mit Cygwin in einer Windows-basierten Umgebung.

Antwort1

Mit awk, nicht sicher, ob es funktioniert aufCygwin

$ awk '{ if(/^alt_id/){$0 = $0" "p} else{p = ""; for (i=2; i<=NF; i++) p = p" "$i} } 1' ip.txt
GO:0000001      mitochondrion inheritance
GO:0000002      mitochondrial genome maintenance
GO:0000003      reproduction
alt_id: GO:0019952  reproduction
alt_id: GO:0050876  reproduction
GO:0000005      obsolete ribosomal chaperone activity
GO:0000006      high-affinity zinc uptake transmembrane transporter activity
GO:0000007      low-affinity zinc ion transmembrane transporter activity
GO:0000008      obsolete thioredoxin
alt_id: GO:0000013  obsolete thioredoxin
GO:0000009      alpha-1,6-mannosyltransferase activity
  • Für jede Zeile, die nicht alt_idmit dem Zeilenanfang übereinstimmt, verwenden Sie eine Variable ( p), um alle Spalten ab zwei zu speichern.
  • Wenn die Zeile alt_idam Zeilenanfang übereinstimmt, wird der Inhalt der Variablen an die in der Variablen penthaltene Eingabezeile angehängt$0
  • Der letzte 1ist eine Abkürzung zum Drucken des Inhalts von$0

Antwort2

Die Aufgabe kann leicht erledigt werden durchsed

sed '
    N  #append next line (operate with `line1\nline2`);
    /\nalt_id/s/\([^0-9]*\)\n.*/&\1/
       #if next line starts with `alt_id` the append end of present line
    P  #print present line (all before `\n`)
    D  #remove all before `\n`, starts from begin with remain part (line2)
    ' file

Eine andere Möglichkeit besteht darin, die Leertaste zu drücken

sed '
    /^alt_id:/G #if line starts by `alt_id:` append hold-space
    s/\n//      #remove `\n`ewline symbol
    t           #if removing success pass further commands (go to end)
    h           #if no (for other lines) copy it to hold-space
    s/\S*//     #remove all non-space symbols from start till first space
    x           #exchange hold-space and pattern-space ==
                #+put resedue into hold-space and return full line
    ' file

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