cómo descargar el enlace ebi fastq a través de la línea de comando usando wget/curl

Question

Tengo muchos datos (fastq) para descargar de la base de datos de ENA.

Example: ERS076383 ERS012262 ERS160574 ERS349280 etc

Link to download via browser: 

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt

Ahora vincularía para reemplazar accession= uno por uno para descargar el texto correspondiente y luego usaría wget para descargar cada enlace ftp asociado con fastq. pero no puedo descargarlo mediante wget.

i tried: 

wget https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt
[1] 61380
[2] 61381
[3] 61382

Redirecting output to 'wget-log'....

pero no funciona.

Answer 1

Debes poner la URL entre comillas, así:

wget 'https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt'

o escapar de los símbolos ( \&).