Isso já aconteceu em várias instalações do Ubuntu em hardware diferente. Quando tiro uma captura de tela de uma área da tela com Ctrl+ PrnScr, cerca de 50% das vezes depois de desenhar um retângulo na tela, a captura de tela nunca desaparece. Você pode dizer que ele nunca é acionado porque o retângulo não pisca. Isso também pode acontecer com capturas de tela em tela cheia, mas eu uso o retângulo 95% das vezes, então só posso confirmar que isso acontece com isso.
Percebi que isso parece acontecer quando faço isso rapidamente, mas se eu criar o retângulo, pausar por um segundo e soltar o botão do mouse, parece funcionar com mais frequência. Alguma resolução para este problema?
Esta pergunta do AskUbuntude 2 anos atrás parece o mesmo problema, mas quem fez a pergunta está tentando resolver um problema um pouco diferente. Uma informação relevante para esse problema é que o Ubuntu, em algum momento, deixou de usar o aplicativo Gnome Screenshot para usar um daemon para fazer a captura de tela quando você clica em PrnScr. Entre outras coisas, o daemon não suporta um local de salvamento padrão, então este pode ser apenas mais um bug por aí.