Qual é a diferença entre instalar um programa e copiar os binários de um programa para algum diretório?

Qual é a diferença entre instalar um programa e copiar os binários de um programa para algum diretório?

Às vezes é suficiente que um programa use, extraia seu tarball e compile o makefile, mas alguns programas também precisam ser instalados. Eu acho que o processo de instalação envolve copiar arquivos para alguns diretórios específicos e modificar alguns arquivos de configuração.

Minha pergunta é: como saber se um programa precisa ser instalado e quais diretórios e arquivos de configuração devem estar envolvidos nesse caso.

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