A única maneira que conheço de instalar, remover e atualizar pacotes snap é inserir comandos no terminal. Serei capaz de fazer isso em softwares Ubuntu ou de alguma outra forma de GUI?
Se pudermos fazer isso, como saberemos se são pacotes instantâneos ou não?
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Sim, você poderá instalar/remover snaps através do software Ubuntu. Esse trabalho está em andamento e parece não ter sido liberado para o Xenial ainda.
Não sei se o Ubuntu Software indicará se é um snap ou um deb.