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como baixar o link ebi fastq via linha de comando usando wget/curl

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como baixar o link ebi fastq via linha de comando usando wget/curl

Tenho muitos dados (fastq) para baixar do banco de dados ENA.

Example: ERS076383 ERS012262 ERS160574 ERS349280 etc

Link to download via browser: 

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt

Agora eu colocaria um link para substituir accession= um por um para baixar o txt correspondente, então eu usaria o wget para baixar cada link ftp associado ao fastq. mas não consigo baixá-lo pelo wget.

i tried: 

wget https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt
[1] 61380
[2] 61381
[3] 61382

Redirecting output to 'wget-log'....

mas não está funcionando.

Responder1

Você precisa colocar o URL entre aspas, assim:

wget 'https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt'

ou escapar do e comercial ( \&).

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