Estou encaminhando o gftp com putty do meu servidor Ubuntu para o meu laptop.
É possível executar o programa de uma forma que permita que ele continue trabalhando no servidor se meu laptop perder a conexão? Melhor ainda seria a capacidade de me reconectar a ele quando eu estiver reconectado.
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Não, não é possível executá-lo usando encaminhamento x11, pois mesmo que a aplicação rode em um servidor remoto, ela ainda precisa se comunicar com nossa máquina onde está rodando o servidor X (e sua GUI).
Você deve usar nohupsem encaminhamento do X11 se não for absolutamente necessário executar a GUI.
Se você realmente precisa de GUI, você deve usar VNC para este caso, já que ele executa toda a pilha no lado remoto.