我要安裝阿納奇在 RHEL 6 上。正如您可以閱讀他們的主頁，ANARCI 需要 Python 2.6+ 和 HMMER3。我下載了 anarci tar.gz 然後解壓縮它。安裝它
python setup.py install --prefix=/tmp/anarci
但是當我運行時/tmp/anarci/bin/ANARCI -h，它顯示沒有名為 ANAARCI 的模組。
在這種情況下如何指定 HMMER 依賴項。如何安裝 ANARCI？
答案1
謝謝回覆。你的建議對我有用，唯一改變的是在 python 之後，我必須將站點包附加到 PYTHONPATH。
因此，導出 PYTHONPATH=/tmp/anarci/lib/python/site-packages/:$PYTHONPATH 完成了這項工作。
2017 年 5 月 29 日星期一下午 6:53，鄧巴，詹姆斯寫道：嗨，Prashant，
對於回覆緩慢表示歉意。
anarci python 模組需要位於您的 PYTHONPATH 環境變數中，並且 hmmscan 二進位（來自 hmmer3）位於您的 PATH 中。
例如，首先使用 bash shell 運行：
導出 PYTHONPATH=/tmp/anarci/lib/python/:$PYTHONPATH 導出 PATH=/tmp/HMMER-3.1/binaries/:$PATH
然後：/tmp/anarci/bin/ANARCI
希望有幫助。如果您還有任何疑問，請告訴我。
最好的，詹姆斯
2017 年 5 月 29 日 15:13，詹姆斯鄧巴 (James Dunbar) 寫道：
---------- 轉發的訊息 ---------- 來自：Prashant Shete <[電子郵件受保護]> 日期：2017 年 5 月 22 日 20:18 主題：抗體編號 - ANARCI 安裝到：[電子郵件受保護]
嗨詹姆斯，
我嘗試從以下位置安裝 ANAARCIhttp://opig.stats.ox.ac.uk/webapps/sabdab-sabpred/ANARCI.php
正如它所說，它需要 python 2.6+ 和 HMMER3。我下載了 anarci tar.gz ，解壓縮它並在 RHEL 6 機器上運行 python setup.py install --prefix=/tmp/anarci 。
我還下載了 HMMER-3.1 ，完成 make，以前綴 /tmp/HMMER-3.1 進行安裝。
但是當我運行 /tmp/anarci/bin/ANARCI 時，它顯示沒有名為 anarci 的模組。是不是因為我沒有指定 HMMER 依賴關係，如果是的話我該怎麼做。